I take it that the price includes breakfast - if that isn't the case, please let us know.

isn't 是 is not 的缩写形式，表示"不是"。 the 是定冠词，用于特指某个事物或情况。 case 在这里的意思是"情况、事实"，指前面提到的"价格包含早餐"这一具体情况。 the case 这个短语表示"实际情况"或"真实情况"，常用于否定句中表示"并非如此"。