I deleted the file by accident.

by 在这里表示"通过某种方式或原因"，常用于表示行为的方式或原因。 accident 的意思是"意外、偶然事件"，指非故意发生的事。 by accident 是一个固定短语，意思是"偶然地、意外地"，与 on purpose（故意地）相对。