I had loved Sean since sixth grade but I was keeping it a secret.

keeping 是动词 keep 的现在分词形式，keep 的意思是"保持、保留"。 a 是不定冠词，表示"一个"。 secret 是名词，意思是"秘密"。 keeping it a secret 这个短语的意思是"保守秘密"，指不把某件事告诉别人。