The trouble with public transport is that it's often delayed.

the 是定冠词，用于特指某个事物或情况。 trouble 的意思是"麻烦、问题"，指令人困扰或不便的情况。 with 在这里表示"关于、对于"，用于引出某个事物存在的问题或特点。 the trouble with... 这个短语表示"关于...的问题/麻烦"，用于指出某个事物存在的缺点或不足。