This means, in effect, that the plan has been scrapped.

in 在这里表示"处于某种状态或情况"。 effect 的意思是"效果、影响"，指事物产生的结果或作用。 in effect 是一个固定短语，意思是"实际上、实质上"，用于强调某事的真实情况或实际影响。