The new software update will be implemented step by step over the next quarter to minimize disruption.

step 的意思是"步骤、步伐"，指具体的行动或过程。 by 在这里表示方式或手段，意思是"通过、按照"。 step by step 是一个固定短语，意思是"逐步地、一步一步地"，表示按照顺序或分阶段进行某事。