The quality of the individual classes differed substantially.

substantially 是形容词 substantial 的副词形式，由词根 substance（物质、实质）和后缀 -ial（形容词后缀）组成，表示"实质上的、大量的"。加上 -ly 变成副词后，表示"实质上地、相当大地"，在句中修饰动词 differed，强调差异的程度很大。