If I don't come back in time, you can put a note on my desk.

in 在这里表示"在...时间内"，强调时间范围。 time 指"时间"，在这个短语中特指"规定的时间"或"适当的时间"。 in time 是一个固定搭配，意思是"及时"，表示在截止时间或需要的时间之前完成某事。