The pandemic has clearly taken its toll on the economy.

taken 是动词 take 的过去分词形式，take 在这里表示"产生、带来"某种影响。 its 是代词 it 的所有格形式，指代前面提到的"疫情"。 toll 本义是"通行费、伤亡人数"，引申为"负面影响、损失"。 take its toll 这个短语表示"产生负面影响、造成损害"，通常指逐渐积累的负面后果。