We didn't mean to leave you all by yourself.

by 在这里表示"通过某种方式"或"处于某种状态"。 yourself 是代词 you 的反身形式，意思是"你自己"。 by yourself 这个短语表示"独自一人"或"靠自己"，强调没有其他人陪伴或帮助的状态。