One by one the old buildings in the city have been demolished and replaced with modern tower blocks.

one 的意思是"一个"，在这里表示"单个"。 by 在这里表示"逐个地"或"依次地"的方式。 one by one 是一个固定短语，意思是"一个接一个地"、"逐一地"，强调按顺序逐个完成某事。