Coming home to find my room in disarray, with everything out of place, was very unsettling.

out 的基本意思是"在外面"，在这里表示"不在"的状态。 of 是介词，表示所属关系或来源，在这里连接"不在"和"位置"。 place 的意思是"位置、地方"。 out of place 是一个固定短语，字面意思是"不在原位"，引申为"错位、不协调"的意思。